Baca Tulis Alquran merupakan salah satu Program Unggulan SMK Kartika Nusantara Semarang dikawal Oleh Tim Pengembangan Program Pendidikan Agama Islam (P3AI) SMK Kartika Nusantara. Program BTQ ini dilaksanakan sesudah pulang sekolah sesuai jadwal yang telah ditentukan. BTQ SMK Kartika Nusantara menggunakan buku IQRO (Jilid 1-6) sebagai pedoman.

Program BTQ SMK Kartika Nusantara adalah sebagai berikut:

1. Bimbingan Baca Tulis Al qur’an
   • Siswa-Siswi SMK Kartika Nusantara
     Bimbingan Baca Tulis Al quran ini dilaksanakan dengan pendeteksian lebih awal di tingkat kelas X. Setelah pendeteksian, siswa akan dibimbing oleh tutor ditingkat pencapaian prestasinya.
     Dan apabila sudah lancar membaca Al Quran, maka siswa akan dimasukkan ke kelas “SMK Kartika Nusantara Mengaji” yang dilaksanakan dengan membaca sesuai pembagian Juz sampai khatam (minimal kurang lebih 1 bulan khatam Al Qur’an).
2. Tutorial Tutor
   • Program Tutorial Tutor ini dilaksanakan dengan dipimpin oleh Ketua P3AI dengan tujuan agar semua tutor pada khususnya dan guru serta karyawan SMK Kartika Nusantara mempunyai kompetensi sebagai Tutor dan dapat membimbing siswa-siswi dalam mengikuti Program BTQ.